企业不得扣押员工的证书。根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定,用人单位招用劳动者时,不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件,包括学历证书、毕业证书、职业资格证书等。如果企业扣押员工的证书,将违反法律规定,并可能面临法律处罚。
具体来说,如果企业扣押员工的证书,劳动行政部门将责令限期退还给员工本人,并可能处以罚款。根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十四条的规定,用人单位扣押劳动者居民身份证等证件的,由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人,并依照有关法律规定给予处罚。如果以担保或者其他名义向劳动者收取财物的,也将受到相应的处罚。
因此,企业在招聘过程中应严格遵守相关法律法规,不得扣押员工的任何证件,以维护员工的合法权益。