常用的方法有：
捕鼠法：以鼠夹、鼠笼等按一定方法布放，根据捕获量估计密度。
查洞法：按规定方法统计一定范围内的鼠洞数，作为鼠密度。既可调重原有洞口，亦要调查堵洞后掘开洞口。有的鼠种可统计洞群数。查洞和捕鼠结合进行亦可。
查鼠迹法：主要用于居民区内，查验布放的粉块上的鼠迹数，或调查一定范围内的鼠类，咬痕数。野外可调查鼠丘、飞翔天敌数等。
直接计数法：可定面积直接观察，亦可按一定线路观察统计。
食饵法：布放食饵，统计消耗量或有消耗堆数。
其他方法：如控沟埋桶，水灌，枪击，统计数量。