对于yuzu模拟器火焰文章engage2.0版本金手指，三种晶石不减少的代码无法使用的问题可能有以下几种原因：
1. 金手指代码与游戏版本不符：请确保你使用的金手指代码适用于你想玩的游戏版本。如果游戏已经更新到新版本，而你的金手指仍然是旧版本的，可能会出现问题。可以尝试查找对应最新版游戏的金手指或者等待开发者更新金手指文件。
2. 互相冲突的金手指：有时多个金手指之间可能存在相互干扰的情况。你可以试试关闭其他所有金手指只开启这个晶石不减量的看看是否能够生效 。如果有其他的金手指和这个功能有冲突的话会导致失效 。需要排查编辑一下，有一个不生效就暂时先不用它 。
3. Yuzu模拟器的兼容性问题：Yuzu模拟器本身也可能存在问题或缺陷，导致某些金手指不起作用。建议检查模拟器的版本并查看是否有可用的修复程序或补丁来解决问题。同时也可以考虑更换其他安卓模拟器如夜神、蓝叠等测试看是否存在相同情况 。
4. 游戏设置影响金手指效果：有些时候游戏中一些特定的设置可能会影响到金手指的效果，比如开启了“禁止使用金手指”的设置等等也会造成无法实现相关操作 ，可以在游戏的系统设置中看一下有没有相关的选项 。此外还要注意保持游戏是最新版的并且未被修改过 。

关于您提到的yuzu模拟器火焰文章engage2.0版本中三种晶石不减少的金手指代码无效的问题，可能有以下几种原因：
1. 金手指代码与游戏版本不符：请确保您的金手指代码适用于火焰文章engage 2.0的版本。不同版本的 游戏可能使用不同的金手指代码。如果您使用的代码是针对旧版游戏的而您正在玩的是新版的游戏，那么该代码将不会起作用。需要找到对应于您当前玩游戏版本的正确金手指码。
2. 金手指开关未启用或设置错误: 在Yuzu模拟器上, 需要先打开模拟器然后再点“金手指”选项，接着再点击“列表”，之后选择对应的金手指码进行输入和编辑在启用之前排查互相冲突或者重复开启的情况。另外需确认是否已启用了金手指功能（即在主界面上的 "Emulation"菜单中选择 “Cheats”）并选择了正确的金手指代码。如果这些步骤有误或不完整可能会导致金手指无法生效。
3. 游戏文件损坏或缺失：有时候由于下载的游戏包不完整或有损坏的文件导致某些金手指无法正常工作。尝试重新获取一份完整的游戏安装包并进行测试看是否有改善。
4. Yuzu模拟器的兼容性问题或bug：尽管大多数情况下，Yuzu模拟器和金手指都能很好地配合使用但偶尔也可能存在一些未知问题这可能需要更新到最新版本的模拟器软件来解决如果官方发布的新版本已经修复了相关 bug，建议您及时升级到最新版本后再试一次。此外可以查阅Yuzu模拟器的帮助文档、社区论坛等地方来寻找类似问题的解决方案或询问其他用户遇到同样情况时的解决办法或许能得到有效的解答和建议。