以下纯属个人推测：
按照目前的剧情发展，个人觉得库赛诺博士是幕后黑手的概率很大。
首先库赛诺博士很强，但是缺乏详尽的背景描述。库赛诺博士长久以来修复小杰的战损，最后又给了小杰龙颠级别的战绩。对于小杰来说，库赛诺博士除了【战力价值】，还有【感情价值】。one设计库赛诺博士的死，更多的是借用库赛诺博士对于小杰的【感情价值】来引燃小杰德复仇导火索，以此推动剧情。one在后期的剧情中，很可能会设计剧情来解释为什么库赛诺博士会有这么强的实力。
金属骑士波佛依和库赛诺博士从年龄、技能、长相上都十分相似，个人感觉one可能是对称设计的这两个角色，按照目前的剧情发展这两人可能有渊源，因为某种理念不合而产生分歧，然后金属骑士表面上是坏的其实是好人，库赛诺表面上看是好人其实可能是幕后黑手。
库赛诺一直执着于收集老师数据，这点与机神系列执着于收集king的数据可能呼应。这个幕后组织通过收集强大个体的身体数据来打造更强的个体。而且说不定老师的身体数据已经被收集，后期可能会据此打造出十分强大的机械个体。
最后就是新一话中小杰出现【理智失控】的表现，虽然可能是被复仇心态蒙蔽了理智，但更多的可能是库赛诺博士提供的机械从中作祟。参看neo全体失控，很难不把这两点联系起来。