到了中期，老千正式登场，先是与或人展开观点冲突。老千认为科技应该利大于弊，而修玛吉亚的出现不仅会暴走威胁人类安全，而且会与人类竞争工作岗位，致使大批人失业。或人则天真的想着只要解决暴走问题，修玛吉亚带来的帮助无疑是巨大的。随后老千表示要发起收购，哉亚与飞电展开对决。
不破这边推灭亡迅雷的线，发现了一直没现身的亡的线索。结果自己调查时被脑中亡的芯片控制，开始分发突袭者腰带。被哉亚总部改造归来的讯则表示自己要成为修玛吉亚的救世主。建造一个既不受人类奴役，也不受亚克控制的桃源乡。先救出了灭，后和老千战斗夺回了蝎子密钥。

亡控制不破欺骗刃潜入哉亚，得到千骑的数据，随后用亚克制造出了金属簇密钥，并交给了或人。
金属簇的巨大力量击败了老千，但自己也被亚克控制。危机关头不破拔下了腰带。
飞电与哉亚比分来到2：2，最后一个比赛就是01 VS 千骑。不破警告说或人在直播下失控会带来无法逆转的后果。
比赛当天，01血战千骑。但千骑强大的力量仍然压制了01，为了保住爷爷的公司和修玛吉亚，或人还是毅然决然地使用了金属簇蝗虫。
亚克带来的巨大的力量近乎击碎了千骑，但老千还是硬生生扛住了进攻，并表示唯有亚克这个机器，自己一定不会输给他。随后释放动物园必杀战胜了亚克的同时重伤或人。
解除变身的老千居高临下地对或人说，这就是作为社长的差距。

老千成为飞电社长后宣布回收所有的修玛吉亚，伊兹和驱动器被收回。或人再次一无所有。
然而一个神秘人出现在他面前，递给他强制驱动器。讯也从飞电公司将宕机的伊兹带了回来，并重启了系统。
随着神秘人摘下兜帽，飞电其雄，或人已死的父亲，又重新出现在他面前。
飞电其雄与讯找上老千，老千变身01应战。二打一01很快招架不住，跳跃蝗虫的密钥掉了下来。关键时刻不破与刃赶来支援，老千得以脱身，01驱动器没有被抢走。

自此阵营又发生了变化，或人和伊兹被父亲带着见到了本该死去的讯和灭。雷也被重新制作了身体。或人依旧对灭亡迅雷不信任，但他父亲却表示借助他们的力量才可以夺回公司。
老千这边意识到灭亡迅雷站已经重新复活，命令刃看好不破后，只身前去剿灭对方。

这次是或人与其雄变身001和1型对战老千变身的闪耀突击01，三个蝗虫打架。
灭亡迅雷这边，内部也并不是一条心。灭和雷连接上了亚克，但是讯一直没有连接。灭对讯产生了怀疑，同时灭也道出了飞电父子惊人的秘密。
另一边，不破也调查起飞电其雄，与刃发生争执，被说服了的刃也告诉了他自己知道的。意识到不好的众人朝或人他们赶了过去。

三个蝗虫的战斗也见分晓，老千招架不住父子双打，被二人合力的骑士踢打倒在地解除变身。
或人告诉这次是他赢了，老千却跪在地上哈哈大笑。此时插入OP。
“你赢了么？既然这样就告诉你一个真相吧。”
“飞电或人，为什么你明明是人类，父亲却是一个修玛吉亚？”
“为什么从小在孤儿院长大？！”
“别再说了！”不破赶来，冲上去制止。
“为什么你的爷爷从来没管过你？！”
“住口！”晚来的讯也朝老千跑了过去。
“答案只有一个。”老千指着或人。
飞电其雄也站不住了，动身跑去。
“飞电或人，你根本就不是你爷爷的孙子啊。飞电其雄早就死了，飞电士之助才因此创造了修玛吉亚代替他儿子。你只不过是飞电其雄捡来的养子罢了。”
“换句话说，你根本就没有变身假面骑士的资格啊！哈哈哈。”老千癫狂地笑了出来。

不破与讯同时停下了脚步，飞电其雄一把抓住老千，将他拎起来，夺下了驱动器和所有密钥。
或人无法接受这个震惊的消息，头疼闪过，之前失去的记忆突然浮出水面。自己一开始就是孤儿，没有名字。被飞电其雄收养后，度过了一段快乐的童年。黎明小镇过后，失去了父亲的或人再次成为孤儿。
“原来是这样。”弄清楚一切后或人开始自暴自弃，原来一切都是假的，自己只不过接受了虚假的身份罢了。
飞电其雄的重生因为是连接了亚克，他对或人的爱一直抵抗着亚克的控制。但这并不能长久。自知时日无多的飞电其雄为了或人，佯装被亚克控制，要消灭伊兹和或人。
为了保护伊兹，或人变身001应战。

老千则表示要先干掉灭亡迅雷，变身千骑和不破、刃一起对抗灭、讯、雷。
001被1型开启高速战斗，但一直被压制。战斗过程中，飞电其雄也在慢慢被亚克控制。
他表示如果或人要恨的话，就恨他吧。是他自作主张收养了或人，一直欺骗他，创造了虚假的关系。
但或人哭着表示怎么可能会恨他啊，虽然他们之间是虚假的父子，但他获得的感情和父爱，一直都是最真挚的。
闻言，飞电其雄释怀地笑了，恳求或人终结他，他不想被亚克控制。
两人对踢，这块跟冬季剧场版那段差不多。
飞电其雄倒在或人怀里，把01驱动器和密钥递给或人。
“无论如何，能看到你平安长大，我的梦想已经实现了。”

老千这边战斗僵持不下，讯带着灭和雷成功撤退。
老千转而看向或人，要求他把01驱动器交还给自己。
或人紧紧握着驱动器和父亲的密钥，随后戴上了驱动器。老千对他发起了攻击。
然而或人却在爆炸中成功变身为01。
原来飞电其雄持有飞电公司除社长外最大的股份，他将这些股份移到或人名下，为他重新开创了一个公司。因此，重新当上社长的或人能够变身成为假面骑士01。
开什么玩笑！愤怒的老千朝着或人袭来。
自此，01进入第三篇章。

伊兹这边趁老千不在重新连接回泽亚，与前面认识的所有修玛吉亚一起，创造出了能控制金属簇失控的剑。然后迅速赶回战场。
在01节节败退之时把剑送到或人手中，并告诉他可以变身成为金属簇01，不会再失控了。
或人相信她，相信一路走来与修玛吉亚们的羁绊。变身成为金属簇蝗虫，手中的剑闪闪发光，抑制住了亚克的控制。
然后就是金属簇乱打老千，让老千爆金币。最后用父亲的灭绝密钥插入剑中正面干爆千骑。
或人回收了几台被丢弃的修玛吉亚，新公司致力于和修玛吉亚一起帮助其他人，让其他人露出笑容。
随之而来的是不破线。老千看着自己打不过金属簇了，开始研究新密钥，并且给刃了突袭者腰带升级战力。
不破这边受亡的影响愈来愈严重，老千借用泽亚结合目前为止千骑吸取的数据创造出目前为止的最强密钥，狂暴加特林。但是发现自己用不了，因为灭绝密钥的性能跟不上。
老千决定交给不破用，但是先得保证不破是站在自己这边的。

不破也发现了自己身体的不对劲，老千则把狂暴加特林摆在他面前。告诉他关于亡的真相。
亡是黎明小镇事件后老千为了监视灭亡迅雷而安插的棋子。在帮老千收集完所有数据，制作出千位驱动器后就被抛弃杀掉了。那时刚好是灭TV初登场，不破重伤，脑中的芯片也损坏。老千就给他换上了亡的芯片，让他能够继续变身成假面骑士。
不破自然是懵的，芯片是啥？
小时候不破和刃就被当做是哉亚的武器培养，在大脑中植入了芯片，作为射击升华器的人选，在TV第二集成功变身。
不破果然出离愤怒了，表示自己的人生自己决定。然而却被老千用哉亚的眼镜把亡唤醒控制住了。老千需要的是听话的武器。老千把狂暴加特林给了亡。

带着亡和刃要夺回01驱动器和伊兹。或人变身结果被正义三打一，狂暴加特林生猛的火力连金属簇也招架不住。
而或人努力唤醒不破，刃也发现自己对伊兹下不去手，放下了镰刀。
刃表示老千只不过把他们当成工具，随手用完就丢掉。亡的意识与不破的意识在脑海中达成一致，无论如何，他们首先要做的就是摆脱哉亚对他们的控制。
或人恰好讲了句冷笑话，狂暴巴尔坎的拳头放了下去。
“真是句不好笑的笑话啊。”不破恢复了意识，强撑着傲娇般来了句。
老千表示不可能，不破则说我和你还有账没算呢。
又是喜闻乐见的暴打老千，让老千爆衣。
这次过后，老千正式成为孤家寡人。刃和不破与讯做了个交易，将亡的意识从不破的脑海中转移出来。
随着亡带着新身体走出，灭亡迅雷站正式复活。亚克篇来袭。