1.缟玛瑙为什么会出现在教堂，和奏有关系吗？
奏把书交给了夜子并带回了图书馆，而且说了谎，说这本书是蓝宝石，实际上是缟玛瑙，但是没看出来这两者之间有什么联系，妃打开书应该和奏没啥关系吧，也不是奏把书交给妃让他带回去的，是妃逃课之后一个人去教堂发现的书才读的，应该是魔法使搞的鬼吧

2.为什么会把缟玛瑙错认成蓝宝石+为什么蓝宝石会在兄妹二人回到教堂时候出现？
百度了下缟玛瑙的图片，缟玛瑙大多是褐色的，和蓝宝石差了十万八千里，这是怎么错认的，而且他们发现的书应该是货真价实的蓝宝石吧，不可能说看着缟玛瑙的梗概结果看成了蓝宝石，这也太假了，既然是这样的话，蓝宝石会出现在教堂也就很奇怪了，缟玛瑙还能说是魔法使搞的鬼，那蓝宝石的出现又是为啥呢

3.暗子在蓝宝石这一章中（除了书关闭之后的部分），根本就没出现过，那为什么在宣布死讯的时候，表现的这么反常？
缟玛瑙暗子明面上是完全没参与进来的，那为什么妃死后她第一反应居然是“这不是魔法书的错”，“这些只是事故” 以及不断地道歉，这也太不合理了吧，试想一下，明明和故事没有关联，但是发现妃死亡之后，她却一口咬定和魔法书没关系，是意外，颇有一种此地无银三百两的感觉

结合以上三点，我有一个大胆的猜测，也是隐藏在黑曜石之下更深的东西。
黑曜石曾经明确说过，打开缟玛瑙的是妃本人，这样就能排除蓝宝石那种情况，即书是根据本人意愿打开的，并非由其他人强制打开的。说到这个书是响应本人愿望打开，就有这么一种说法：因为妃追求不幸才会开这本书，最后才导致自己的不幸结局，一切都是她活该。我是不认同这种说法的。妃所说的追求“不幸”与翡翠中的追求不幸有着本质上的区别。翡翠中的追求不幸是真正意义上的不幸，让自己处于弱势地位，来吸引主人公的注意。而妃所说的追求不幸，仅仅是情话而已，指的是两人在健全的社会制度下，走向禁忌的，不被认可的关系，是这种类型的不幸，而不可能是追求被ntr这种另一种层面上的不幸。
既然不是妃渴望缟玛瑙的内容，那为什么那本书是缟玛瑙而不是其他更友善的书呢？我们回顾一下，当时说出魔法书设定的是谁。没错，就是夜子，晚上再回去找找原文，大抵意思是，打开书的人渴望什么，就会打开什么样的书。然而在我们通关游戏，了解完一切的真相之后，会发现一个与之相悖的事实：书出现在不同的人面前，其实并不是那个人本身怎么想，因为书是魔法使送出去的，也就是说，那是魔法使擅自决定每个人的想法，再将有相似情节的书送给不同的人，也就是说我们得出了一个很重要的结论，即是：书的内容与打开书的人内心想什么其实是并没有必然的联系。太好了，一旦得出这个结论，我们就没办法说这是妃本人追逐不幸的愿望才害死她自己的

结合上一个结论，我们又发现了更多新的，有趣的东西。还记得小岛上的流言吗？白发红瞳的魔法使，会带来不幸。
根据我们已有的线索，以及游戏中这么多的章节，我们不难发现流言是真的，白发红瞳的就是魔法使，带来不幸则是她所带来的魔法书，这样说可能会不太好理解，但是换个说法可能大家就恍然大悟了。
魔法书的设定，其实就是“黑圣杯”，魔法使会满足打开书之人的愿望，但是很有可能会以一种扭曲的方式来实现愿望，甚至曲解他人的愿望，此事在《黑珍珠的求爱信号》中亦有记载。同理，打开缟玛瑙的妃并没有错，只是她们低估了魔法书的危险和险恶程度，被黑书坑了一把

如果我们继续挖魔法使的动机，即保护夜子，那么不难看出另一个人的身影，就是暗子。没错，妃之所以打开的是缟玛瑙，很明显暗子才是幕后的推手。魔法使与夜子的对话中有提到，夜子是继承了污秽血脉，很有可能就是暗子一脉（也就是神宫寺一脉，剧情中有提到过神宫寺一脉与魔法书也是有渊源的），那就有可能暗子有和魔法使认识，魔法使根据暗子的指示去“帮助”夜子。
回想一下缟玛瑙的结局吧，缟玛瑙的结局会让兄妹二人关系彻底破裂，最大受益人就是暗子他们，对应《月社妃》的职责。也就是说，是暗子安排的《缟玛瑙》，目的就是拆散兄妹俩的恋情。
如果把暗子放在幕后推手这个位置，那就能解释前面提到第三点暗子的反常了。暗子安排让魔法使偷偷把缟玛瑙放在妃面前，让妃打开缟玛瑙，然后随着剧情推进，最终就能成功拆散两人的恋情。这样的话，也就有了蓝宝石出现在教堂的动机。首先能把蓝宝石放教堂的，除了魔法使，也就暗子有这个能力了，但是魔法使后面是单独拿了缟玛瑙给妃看的。如果是魔法使放的蓝宝石，就显得有点多此一举了，那么大概率就是暗子把蓝宝石放在教堂，骗两兄妹是个和平的故事。
然而魔法使非要跳脸，妃以命反抗。暗子知道，是因为自己诱导妃打开的缟玛瑙，才导致妃的以死相抗，所以当暗子得知此事的时候才会有这么奇怪的反应（自责，推卸责任）。明明没有参与在故事中，却第一时间为魔法书开脱，为自己开脱（也就是前文图片中琉璃对暗子这些话的反应），一切就都变得合理起来了。

暗子和夜子是多么的相似，这句话就是缟玛瑙背后暗线的伏笔啊，暗子对夜子，缟玛瑙对蓝宝石，唉，暗子真是纸魔这个故事中的万恶之源

有点道理。仔细一想，剧情里面主角团都面对过魔法使，唯独没有暗子与魔法使见面的场景，二人没有同时出现过，即使在回忆里也没有。而暗子将保管魔法书的任务正式交给夜子之后，魔法使才逐渐登上舞台。
简单分析暗子的心理的话，肯定是夜子大于一切，所以才会不惜耗费生命也要编写《月社妃》和《四条琉璃》。而除了夜子之外的人，她压根就没关心过。

有一定道理，但是暗子应该不是幕后推手。第一，暗子不知道兄妹的恋情，推动夜子和琉璃的爱情不急于一时，第二，在有条件有时间精心谋划的情况下，如果是可以掌控魔法书的暗子做的肯定能做的更好，不至于把自己的生命搭进去。对暗子而言，自己是夜子的母亲，妃是夜子重要的友人，琉璃是夜子的单恋，三者都很重要，单从利弊考虑暗子也不会牺牲前两者，成全第三者

又仔细看了下黑曜石，算是捋清楚了缟玛瑙的顺序了
书是沟槽的魔法使放的，因果目录第五面有暗子的自白，妃打开书在暗子的意料之外，结合前面魔法使的自白，她和暗子目的接近，是为了拆散兄妹才搞的鬼，而作为书的管理者，暗子自然知道这事，同时也决定不干预这事，她许可了这个故事，而且蓝宝石大概率就是暗子所放，为了骗他们是一个和平的故事，好让缟玛瑙平静走完。从暗子对这件事的意外，加上蓝宝石莫名出现在教堂，魔法使拿着缟玛瑙去找妃作死，这几件事串起来之后确实能发现暗子和魔法使没有什么联系，只是魔法使作为类似黑圣杯的存在，单方面解读夜子暗子的愿望去行动罢了。
而且暗子自己也知道妃的死她有不可推卸的责任，是她允许了故事的进行（应该是指没有撕书），所以才会在创造潘多拉的时候不断道歉，也在缟玛瑙合上之后说出那番推卸责任的狡辩的话。

整个图书馆一半的人都知道两兄妹的事，理央暗子知道，汀察觉到妃有喜欢的人，只有夜子蒙在鼓里

相比之下，我更倾向于魔法书回应夜子去拆散兄妹。之前就有剧情描写夜子对兄妹疑似情侣的关系感到动摇（似乎是开玩笑之类的，记不清了)，魔法书回应夜子去拆散兄妹合情合理。另外最重要的是，还有一个铺垫，在兄妹和夜子三人去教堂取书的路上有这么一段剧情，讲的是夜子夺走了妃的冰棒，而冰棒在那段剧情里隐喻为平凡的幸福，换言之，夜子夺走了妃的幸福，即接下来的结果，妃失去了生命

我只有一点很不理解，妃当时为什么不找奏？虽然书可能会被藏起来撕不着，但是找成年人帮下忙的流程好歹走一下吧，手里都有奏的名片了。

恭喜你发现了一个暗线的真相