多试验了几次之后，我好像找到问题原因了。
制造舰载机的生产线开关似乎是必须通过某种方式才能激活的。而激活方式是到达可以制造机库的位置去。如果按照正常游戏流程，那么机库是必须要开采到蓝矿才能造的。
如果玩家正处在不可能开采到蓝矿的银河边缘位置，那么根本不可能造得出机库，虽然有舰载机出售，但也不可能买来用，更不可能造。
由此，如果玩家当前正处于蓝矿区域之外的位置，那么就不可能拥有制造机库的资源。由此，哪怕是有了装配区也无法制造舰载机。因为资源不可能有，对吧？
因此，哪怕是玩家通过控制台指令或者其他方法获取了可以制造机库的蓝矿以上资源，如果你正处在原本就不可能造出机库的位置，装配区和生产线也无法正常启动。
解决问题的方法是使用teleport指令，直接跳跃到接近银河中心的位置，再制造机库和流水线。这样好像就能正常运行了。