但康熙明显低估了三藩。
吴三桂等人具有一定实力，隐藏的兵力很多。且清初六大弊政，不满者众多。西南地区在清初山高皇帝远，许多地区长期被永历统治，明朝灭亡不久，怀念的人还很多，进入清朝又是三藩领地，而不是皇帝管理，对清廷不感冒。吴三桂一起兵，云贵四川乃至湖南都有大批官兵不战而降。康熙却没有实现派兵在外围警戒。导致一下子失去了好几个省，还浑然不知道。江西湖南也有很多人加入三藩阵营，一些地方的汉军，农民，奴仆都迅速响应三藩，或者自己拉队伍抗清。

其次是清朝对全国的控制力问题，康熙高高在上，年轻气盛，对全国认识处于一个不断学习的阶段，还没孝庄太后那么老成。在清廷控制的地区，也有人开始动作，比如说察哈尔亲王，“朱三太子”，青海蒙古，郑氏家族，都起兵对抗。而吴三桂每年也与格鲁派大和尚和青海蒙古交好，每年通过茶马古道从西藏买进蒙古马数千匹，吴三桂起兵后，和尚还派使者对康熙提出“裂土罢兵”的要求，明里暗里施加压力，导致“三边动摇”，甚至李氏朝鲜也记载，他们暗中准备军队进攻东北

吴三桂的部下成分太复杂，大顺，大西，南明，关宁等等，都没有直接接受过清廷领导，其实不是嫡系，如果没有吴三桂罩着，他们这个集团肯定是康熙接下来要对付的目标，一旦撤藩，康熙留着这些军队显然是和自己过不去，这些人也清楚得很
另外陕西提督王辅臣，贵州提督李本深，四川总兵吴之茂，云南总兵王屏藩都是吴三桂的旧部，所以一荣俱荣，一损俱损，所以吴三桂一起兵，贵州3万人，云南3万人，四川3万人立刻倒向吴三桂，吴三桂轻易的打到长沙，一下子就占领了西南，而且王辅臣还在西北反叛，其拥兵数万，攻克兰州，延安等地，杀清朝西北经略莫洛，这可是康熙的重臣心腹

因此，吴三桂反叛后，战火席卷大半个中国，很快清军兵败如山倒，康熙不得不抽调精锐驻扎在湖北荆州，防范吴三桂部渡江，另一部进入江西，防止吴三桂进入江南，同时还要对付察哈尔，西北王辅臣，北京朱三太子，河北总兵蔡禄，连中原内地也不稳定。
耿精忠率兵4万，分路攻击浙江，福建，江西，与清朝亲王杰书相持于浙江，另外郑经接到吴三桂的信函，从台湾起兵，出动刘国选，施琅等人袭击厦门，潮州，等广东福建沿海地区，并登录抢占地盘，尚可喜声称被儿子尚之信劫持，由尚之信反叛，占据广州，消极跟随吴三桂，自己则扮演清朝的忠臣角色，两面下注，孔有德的女婿孙延龄，占据桂林，响应吴三桂，这样云南，四川，贵州，福建，广东，台湾，湖南，广西，甘肃等省份都不在清朝的掌握中，吴三桂出兵三个月，竟然席卷了7~8个省份，康熙到了最考验的时候。

吴三桂具有嫡系兵力包括，
按照八旗待遇的旗兵53佐领，每个佐领可出200人，一共一万人，
另外还有绿营兵四镇十营，万人左右，
以及他所能控制的“忠勇营”“义勇营”12000人，总共30000多正规军
这些兵力不可小看，他们来源复杂，对清朝感情很淡，并且许多都有丰富的作战经验。这时候大顺军，大西军，南明军的余部有不少都被纳入其兵力。

谈谈战争本身，吴三桂的兵力号称杀死清军将校900人，包括护军统领哈克三等八旗大官，也曾影响10几个省份，但为什么最终输掉了战争啊？从军事上本身说的话，
首先在于没有一个明确的战略目标
吴三桂集团从擒杀永历，可以看出，的的确确是想要忠于清朝，苟安于世。顺治与吴三桂曾经有盟约，与本朝山河相始终这个意思，多尔衮也曾自称永不相负，吴三桂自己也曾想明朝的云南沐国公那样永镇边疆，成为独立王国。但是政客的说辞又怎么能当真？康熙一亲政，就开始向吴三桂掺沙子，加入朱国治等人，兑水分化瓦解，最终开始撤藩。康熙说他是因为吴三桂必反才主动进攻，其实后面看这不一定全对，因为吴三桂有被康熙逼反的情节。当然了，哪个国能容忍国中之国？
在这个背景下，吴三桂也不知道自己该干什么，这一点就不如康熙，康熙有一点战略思想是贯穿始终的，就是撤藩，统一，加强对全国的控制。而吴三桂虽然说要把清朝赶出关外，但是实际操作，却又想要划江为国，在长江以南割据，战略目标极为不明确，行为反复，浪费了有限的时机
前面说到吴三桂起兵反叛后，不到三个月就攻克西南数省，饮马长江，占领长沙，岳阳与清军对峙，但是整整三个月，他没有抓住闪电战的有利时机，趁着打了康熙一个闷棍，对方严重低估三藩实力而不知所措的这么一小段时间，采取大的战略动作，以求极大打击对方；而是在湖南原地不动，和康熙外交谈判，拉锯撤锯，心存幻想，直到康熙把北京的吴应熊处死后，康熙坚定的不妥协打破了吴三桂的一切幻想，但这个时候最佳的时机已经过去了，清军调动全国的资源像吴三桂集团进攻，最终消灭了三藩

因为耿精忠无谋，也不意志坚定，幼稚，尚可喜，孙延龄这几个二五仔一边打清军，一边与康熙书信往来，郑经格局有限，只知道在台湾周围抢地盘，最终被清军赶下海，康熙看清楚了，孤立吴三桂，包围大西南。
康熙的谋略实现后，吴三桂就很难办了，侧面全部被包围，只剩云贵老家和湖南突出部，羽翼全部被解决，他也没有太好的招数，于是想出一个振奋人心的计策，就是称帝
其实所谓建立“大周”王朝，称帝昭武，也只有西南部分地区和湖南而已，孤立的战略形势没有改变，但是吴三桂这么干，使得明朝的支持者很不满，觉得吴三桂是一个野心家，利用明朝做旗号做自己的事，更加失望，本来吴三桂名声就不好，又出此下策，导致失去了更多人支持，自己军心也没有更好。
吴三桂看到这个情况，决定用军事进攻打破局面，他派出大将马宝，带领五万人和大象，进攻永兴，准备先拿下两广，安定后方。虽然马宝很有能力，在永兴打了大胜仗，而且吴三桂据守的长沙——岳阳防线的水陆军也能和清军暂时对峙，维持战略相持，但吴三桂没有三头六臂，西北和四川的丢失是顾不上了，首尾不能相顾。终于吴三桂还是又老又病，先走了一步。
吴三桂完蛋对于他的军队显然影响是灾难性的，吴三桂集团完全是靠他的个人人脉纠集起来，加入了各种各样的利益集团。无论官民百姓，加入吴三桂的，无非希望吴三桂用自己的军事能力打出一片天下，好实现某些理想，但是吴三桂后继无人，没有人有这么高的军事资历，所以吴军群龙无首，陷入混乱。
吴三桂的军事集团，其兄弟子侄也很重要，侄子吴应期和女婿郭壮图争夺领导权，导致分裂内斗。吴军的湖南前线很快瓦解，岳阳，长沙，衡阳，常德，辰州等地先后失守。吴军被清军击溃，像赶鸭子一样的赶回了云贵高原地区。
西南的战事已经大体稳定，随着吴三桂孙子吴世璠反攻失败，大将马宝，胡国柱，夏国相等将兵败自杀或被俘，康熙已经能集中主力包围昆明，由彰泰，准塔和赵良栋率领的四十万大军包围住昆明的几万叛军，康熙的圣祖实录在晚年才透漏了这一机密数字，城中的吴军看到形势不妙，抵抗数月后终于兵变。吴世璠看到这样的情况，就战败自裁，谋主郭壮图也举家自尽。清军终于扫平了云南。两年后1683年，郑成功旧部施琅投降清朝，清军进入台湾，郑成功的余部也投降了，清朝完成了对南方的“再征服”，终于稳稳的控制了全国。

但是事情还没有结束
一般地说，历史书记载的是王侯将相的历史，或者胜利者想要的历史，但是脸谱化的历史形象，无疑像幼稚园一般的幼稚，与事实相去甚远
清军平定三藩，有维护国家统一，平定战乱，消灭吴三桂的利益集团的一面，这是任何历史书都大书特书的
但另一方面，战争吃亏的是老百姓，全国各地尤其是西南地区反复争夺，百姓伤亡无算，连清朝官员都承认，王师泄愤时，难免玉石同碎，湖南和云贵的百姓遭到重大伤亡
康熙不信守承诺，承诺对于政客们而言无非是摆设，康熙曾经为了分化三藩，许诺耿精忠，尚之信和王辅臣不死，但是最终杀了耿精忠全家，尚之信也被解决，王辅臣料到不能逃过，自己自尽，而后康熙对于放下武器的吴三桂集团成员，也没有含糊。据说斩了吴军核心部队的副将（副总兵）以上所有人，家属满16岁的男丁全部斩首，女眷发给披甲人为奴，总共杀了上万人。这还不算，剩下的人也发配关外，成了站丁，在关外的吉林，黑龙江甚至外东北苦寒地区永远给清朝站岗，不许考科举，不许回关内，还有的在承德木兰围场，世世代代给清军当奴隶，这样被清算的有30000人以上，要不是辛亥革命，他们永永远远在关外站岗
清朝对于吴三桂集团，清算的很彻底，除了杀光吴三桂全家以外，对于其部下，也是追究到底的，到了乾隆时期，看到关外的气候实在是艰苦，说以后流放宁古塔的人都不用去了，去辽阳就可以了，但是三藩集团的后代仍然不能向南一寸，仍然留守在黑龙江甚至外东北，世世代代永远清算，这些人已经和吴三桂没有任何关系，甚至一开始也没有太大关系，但清朝核心的满蒙成员实在太少，面对众多人不得不小心
最后还生存的掌握军权的汉人绿营兵就是宁夏的赵良栋，率领陕甘绿营夺下头功，昆明之战更是纪律严明，进城后不烧杀抢掠的军队也只有他的部下，但是康熙也没有放过他，找了理由说他为自己争功，心胸狭窄，夺了他的兵权，险些收拾他的家族，直到乾隆时期，才封他为伯爵
此后康熙的八旗联盟收回了所有的军事指挥权，督抚以上除了雍正时期用过岳钟琪以外，直到曾国藩之前再也没有用过八旗以外的人，清算了降兵降将，完成了彻底的征服
真正的历史永远比书上的复杂，大的定性当然是需要的，吴三桂等人的叛徒属性，煽动战争的一面早已广为人知，但是事实上脸谱化的“好人”“坏人”难以形容复杂的历史，只有旁征博引，才能还原真相，像侦探一样搞清楚历史的发展轨迹，复杂的利益关系，和被记载英雄史帝王史忽略的下层人民

最后还生存的掌握军权的汉人赵良栋，率领陕甘绿营夺下头功，昆明之战更是纪律严明，进城后不烧杀抢掠的军队也只有他的部下，但是康熙也没有放过他，找了理由说他为自己争功，心胸狭窄，夺了他的兵权，险些收拾他的家族，直到乾隆时期，才封他为伯爵
此后康熙的八旗联盟收回了所有的军事指挥权，督抚以上除了雍正时期用过岳钟琪以外，直到曾国藩之前再也没有用过八旗以外的人，清算了降兵降将，完成了彻底的征服
真正的历史永远比书上的复杂，大的定性当然是需要的，吴三桂等人的叛徒属性，煽动战争的一面早已广为人知，但是事实上脸谱化的“好人”“坏人”难以形容复杂的历史，只有旁征博引，才能还原真相，像侦探一样搞清楚历史的发展轨迹，复杂的利益关系，和被记载英雄史帝王史忽略的下层人民
本文19年原发于燃烧的岛群论坛，参考了学者李治亭的《吴三桂大传》，《清史稿》，《圣祖本纪》，和知乎的墨舞的记载，谢谢他们

本文同步发于历史吧，可惜因为系统限制和抽楼，不得不减少和修改了许多篇幅，导致意思稍有改变，抱歉