第一部分摘要：米勒实验原始汤第一类深海热泉口（黑烟囱）

(一)生命科学的皇冠——我们究竟在追寻什么？
史铁生说：“人是被抛到这个世界上来的。”或许如此吧。仅透过人的认知、实践和视野看，世界毫无目的，我们似乎天然地被框定在各种规律的桎梏中。然而，既生而为人，便有意识，意识催生自我，自我又拷问意识，追寻人在宇宙中的位置，而这追寻的终极、构成一切位置的第一推动和根本原因的，便是起源问题。换作最经典的提问，即是“我们究竟从哪里来？”

起源问题，贯穿了整个的人类文明史，所有文化活动，无论是神话、宗教还是哲学、科学，都不得不把起源问题作为自己的终极内核。

生命是时空中异质、低熵、动态和非周期性的独特构型（*注2）。这样一句论断放弃描述生命复杂的生理、行为和令人咋舌的多样性，仅仅试图提取生命最本质的“基底”，从而引领我们发现生命起源最核心的问题：化学、热力学和生物学的问题，这也是后文需要细细叙说的内容。
需要注意的是，科学并不是历史学或者侦探学，即使有一天我们可以从试管中摇出生命来，我们仍无法断言这个过程是否真实发生过。30多亿年足以湮灭我们所能想象的所有物质证据，也许在时光机被证明可能之前，我们将永远无法探知和还原地球历史上对所有生命意义非凡的一天究竟发生了什么。但不必沮丧，科学追求的不是特例，而是宇宙中亘古不变的规律，也许真的存在一条用数学写成的“生命定律”，而宇宙所有的生命都将在这条定律的执掌下从混沌中脱颖而出——这才是追寻生命起源在科学中的终极目的。
但生命起源到这就结束了吗？这就是我们的终极追求吗？显然不是。生命起源，远不止是科学的问题（*注3）。在科学的视野里，我们可以领略生命运行的规律，但这运行对人对、宇宙的意义在何处？这终极追寻之问，只得交由各位读者了。
注1：这并不是指宇宙起源和人类起源不适合科学的介入，我们无法否认大爆炸学说和认知科学做出的伟大贡献，但奇点之前的“无”和人类的“自由意志”都是科学无法触及、哲学只得悬设、一般归于宗教信仰的对象。从这一点来看，宇宙起源和人类起源都不算完完全全地被科学解释。
注2：生命是为构型意在指出生命具有自我更新和自我复制的特点，因而生命的特殊性不在物质的特殊性，而在物质集成方式的特殊性。
注3：单从历史来看，生命科学就远不及生命起源来得古老久远。回溯（现代）生命科学的历史，大概只能到公元前四世纪的亚里士多德。亚里士多德是生物学系统化的第一人，对动植物进行了解剖和生活史观察，并完成了对五百多种动植物经验分类。而“上帝创世”（犹太传说、圣经旧约）、“女娲造人”（中国古代传说）和“原始丘”（古埃及神话）等关于生命创生的传说却几乎可以追溯到人类文明的发端。

后文提纲：
(二) 构件起源——生命分子的自然合成
（三）热力学起源——低熵体的推动力
第二部分摘要：第二类深海热泉口（蛇纹石化）土卫二
(四) 生命结构起源1——细胞和生物能量反应堆
(五) 生命结构起源2——底层核心生化反应追溯
(六) 土卫二——另一处行星之声
(七) 物质、生命、意识——开拓的未来

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(二) 构件起源——生命分子的自然合成
任何关于生命起源的叙述都不得不从生命的化学起源说起，也就不得不提及大名鼎鼎的米勒-尤里实验（Miller-Urey experiment）。其实这是很自然的，在发现生命起源的细节之前，一般人第一时间想到的也一定是生命基本的组成元件，具体而言，就是生命体的构件分子——氨基酸、糖类、脂质等等。且不说米勒的观点命运如何，单凭他创造性的实验工作，米勒就足以名垂青史，他对有机分子自然合成的研究也可以视为现代生命起源研究的发端。

(Fig1.Stanley Miller)
虽然实验定名为Miller-Urey实验，但其实主要工作就是Miller做的，原因其实也很简单，尤里其时已经是蜚声学界的诺贝尔化学奖得主了，怎么可能和一个当时还是普通博士研究生的Miller一起搞这个莫名其妙的装置呢。事实上，米勒一年都不一定能得到几次导师的亲自指导。因为缺少指导，米勒便转到另一位研究行星物理学的教授手下去了。在那里，他获得了一个重要事实：远离太阳、历史上可能变化较小的巨行星（如木星和土星等），它们的大气都是没有游离氧（O2）的还原性大气，其主要成分是氢（H2）、氦（He）、甲烷（CH4）和氨（NH3）。既然太阳系的行星们都是一团星云生出来的，那早期地球的大气环境想必也是这般的还原性大气，而这种还原性的气氛，会不会成为生命构件分子合成的原料呢？
米勒一拍大腿（我猜的），动手设计起来他的实验，装置就长下面这样：

米勒在一个大烧瓶中装了水和氨气（后来的改进实验换为氮气，因为氨气易分解且极易溶于水，不可能在地球长期高浓度存在）、甲烷、氢气等混合气体，向这团混合气体通入电火花来模拟闪电，然后等待。分别在几天、几周、几个月后，他从中取了样进行分析，来判断他到底煮了些什么出来。而他的发现超越了他自己最狂野的想象。
他所创造的是一锅原始汤，一堆近乎神秘的有机分子混合物（约20种有机物），其中有几种氨基酸，而且不是稀奇古怪的氨基酸，恰恰属于我们生命体使用的20种氨基酸——在DNA尚未出名的上世纪五十年代，这种蛋白质的组成部件无疑是最具象征意义的生命分子。后续的进一步改进实验（1973年）中，添加了原始地球可能发生的光解（那时没有臭氧层，紫外线极强）和热解（地球早期频繁的地质活动）过程的模拟，烧瓶中甚至产生出生物使用的20种氨基酸中的17种 。